Synopsis
À Prague, l’agent Hanaway est tué par Sabine Moreau. À Moscou, Ethan Hunt, emprisonné, est libéré par deux agents de l’IMF : Jane Carter et Benji Dunn. Leur nouvelle mission : infiltrer les archives du Kremlin pour identifier "Cobalt", un terroriste visant une mallette contenant un système de lancement nucléaire russe. Hanaway avait récupéré les codes de lancement. Et Cobalt avait engagé Moreau pour s'en emparer. Au Kremlin, Kurt Hendricks (alias Cobalt) fait exploser une bombe. Tout juste arrivé avec Jane et Benji, Ethan est soupçonné et arrêté par l'agent russe Sidorov. Il parvient à s’enfuir et rencontre le ministre de la Défense, accompagné de son analyste William Brandt, qui lui annonce que l’IMF est sous le coup du "Protocole fantôme" : tous ses agents sont désavoués. Ils sont attaqués par Sidorov, et seuls Ethan et William survivent. Ils partent à Dubaï, où Moreau doit vendre les codes à l'assistant d'Hendricks. Jane, qui était avec Hanaway, se venge en tuant Moreau, tandis qu’Ethan ne peut intercepter l’acheteur (Hendricks lui-même). William avoue qu'il avait échoué à protéger Ethan et sa femme, Julia, qui avait été enlevée et tuée. Ethan identifie le satellite dont Hendricks va se servir : à Mumbai. Mais Hendricks a déjà lancé une ogive vers les États-Unis et se jette dans le vide avec la mallette de contrôle. Ethan parvient à atteindre la mallette et désarmer l'ogive. Sidorov arrive sur les lieux : l’IMF est lavée de tout soupçon. À Seattle, Ethan observe Julia de loin...
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